한국어

?

단축키

Prev이전 문서

Next다음 문서

크게 작게 위로 아래로 게시글 수정 내역 댓글로 가기 첨부
?

단축키

Prev이전 문서

Next다음 문서

크게 작게 위로 아래로 게시글 수정 내역 댓글로 가기 첨부

24post.co.kr_003.jpg

 

전사조절 (유전자 발현) 은 우리 모든 생물학에서 중요함

 

근데 이 중요한게 너무 복잡해서 많이 밝히지 못함

 

또 기존 모델들은 특정 유형의 세포나 조건에 국한되어서 

 

범용적으로 사용하기엔 무리가 있음

 

 

 

 

24post.co.kr_004.jpg

 

그래서 만든게 GET  모델

 

일단 213개 인간 세포 유형의 scATAC-seq 데이터에서 추출한 염색질 접근성 및 TF 결합 부위 정보와

 

2Mbp 이상의 genomic locus 를 입력후

 

무작위로 마스킹 된 영역에서 motif 결합 점수 및 접근성 점수를 예측하도록 학습시켰음

 

 

 

24post.co.kr_005.jpg

 

이후 미세 조정은 scATAC-seq와 RNA-seq 데이터가 쌍으로 존재하는 153개 세포 유형 데이터를 사용하여, PolII가 염색질 환경을 읽어 유전자 발현을 조절하는 과정을 모방하도록 학습함

 

그랬더니 유전자 발현 예측을 잘함

 

24post.co.kr_006.jpg

 

 


 

학습에 사용되지 않은 세포 유형에서도 유전자 발현을 엄청난 정확도로 예측함

 

Pearson correlation 0.94, R2 0.88, unseen fetal astrocytes

 

대략 90%이상의 예측을 함

 

이는 다양한 세포유형에 대한 유전자 발현 예측을 할 수 있다는 소리

 

 

 

 

또한 태아 데이터로만 학습했음에도 성인 세포 유형의 유전자 발현을 정확하게 예측가능

 

다양한 시퀀싱 플랫폼과 분석법에 적용가능

 

제로샷(Zero-shot) 예측도 가능

학습없이 규제요소의 활성화를 예측했는데 기존 분석기 Enformer보다 정확함

 

 

24post.co.kr_007.jpg

24post.co.kr_008.jpg

 

 

결론

 

Transformer 기반의 범용 전사 조절 모델을 개발하고, 

self-supervised pretraining, fine-tuning, model interpretation, causal discovery, AlphaFold2 연계 

 

등 최신 기술을 융합하여, 

 

 

“전사 조절 연구의 새로운 지평”을 열었음

 

 

 

 

요약

 

여태 어려워했던 전사 조절의 기본 원리를 이해하고, 

 

질병 메커니즘을 규명하는 데 중요한 기여를 할 것으로 기대됨

 

또한 

 

이미 얘를 가지고

 

소아 백혈병의 새로운 발병기전 발견,

태아 헤모글로빈 조절기전 규명,

TF 상호작용 네트워크 구축에 성공했음

 


 댓글 새로고침
  • tpcmsk 2025.01.10 14:33
    내 유전자좀 바꿔줘...
    0 0

List of Articles
번호 분류 제목 글쓴이 날짜 조회 수 추천 수
베스트 글 mp4 ㅇㅎ) 당신의 귀중한 2분30초를 빼앗겠읍니다. 5 newfile 재력이창의력 2025.07.24 1337 3
베스트 글 jpg 기상청)올여름 더위 역대 최악...내주 중반 이후 '폭염 아니면 폭우'.news 4 newfile 재력이창의력 2025.07.24 505 2
베스트 글 mp4 후방) 파도를 조심해야하는 이유 2 newfile 대단하다김짤 2025.07.24 512 1
베스트 글 mp4 엄마한테 온리팬스 수익을 알려주는 딸 3 newfile 대단하다김짤 2025.07.24 472 1
베스트 글 mp4 워크돌) 중국불체자 쫓아내서 화난 시장사람 3 newfile 대단하다김짤 2025.07.24 319 1
베스트 글 gif 피규어 만드는 손놀림 5 newfile 대단하다김짤 2025.07.24 412 1
베스트 글 jpg 베트남 다낭 호텔 비추 후기 ㄷㄷㄷㄷ 3 newfile 재력이창의력 2025.07.24 914 1
베스트 글 mp4 ㅇㅎ)격하게 반겨주는 지원 newfile 대단하다김짤 2025.07.24 720 1
베스트 글 jpg 추격자 곡성 나홍진의 신작 HOPE 3 newfile 대단하다김짤 2025.07.24 351 1
베스트 글 jpg 조니 소말리, 전범기 들고 또 망언 6 newfile 대단하다김짤 2025.07.24 241 0
360234 jpg 헬스 시간 없어서 못한다는 건 핑계인 이유 newfile 재력이창의력 2025.07.25 74 0
360233 jpg 요새 어린애들은 절대 안 쓴다는 특수문자 newfile 재력이창의력 2025.07.25 69 0
360232 jpg 배우 박영규가 MRI 검사를 중단한 이유 newfile 재력이창의력 2025.07.25 57 0
360231 jpg 초보 러너가 10km 마라톤 뛰었다고 하면 받는 댓글 newfile 재력이창의력 2025.07.25 55 0
360230 jpg 한국소비자원, 전국민 폼클렌징 구매 가이드 newfile 재력이창의력 2025.07.25 54 0
360229 jpg 한가인 당근마켓 온도가 낮아진 이유 newfile 재력이창의력 2025.07.25 55 0
360228 jpg 요즘 라면 먹고 갈래?? 대신 한다는 말 1 newfile 재력이창의력 2025.07.25 67 0
360227 jpg 중국, OnlyFans 전면 차단. newfile 재력이창의력 2025.07.25 66 0
360226 jpg 휴게소 키즈메뉴 근황 newfile 재력이창의력 2025.07.25 48 0
360225 jpg 롤스로이스 사건 충격 근황 newfile 재력이창의력 2025.07.25 75 0
360224 jpg 암표 되팔이 쓰레기들을 정상화 시키는 롯데 자이언츠. 1 newfile 재력이창의력 2025.07.25 62 0
360223 jpg 귀화한 사람 민생쿠폰 총 85만원 수령에 '악플세례' newfile 재력이창의력 2025.07.25 67 0
360222 jpg 미국 레슬러 헐크호건 71세 별세 newfile 재력이창의력 2025.07.25 51 0
360221 jpg 충격의 중국집 간짜장 사태 newfile 재력이창의력 2025.07.25 71 0
360220 jpg [속보] 헐크 호건 사망 newfile 재력이창의력 2025.07.25 47 0
360219 jpg "말려 죽이는 법 안다" 자녀 담임에 폭언 퍼부은 화성시 6급 공무원…결국 직위 해제 newfile 재력이창의력 2025.07.25 33 0
360218 jpg 지금 미국에서 난리난 사건.x newfile 재력이창의력 2025.07.25 51 0
360217 jpg 황의조 "매일 반성한다" 울먹…검찰, 2심 징역 4년 구형 7 newfile 대단하다김짤 2025.07.24 418 0
360216 jpg 오늘의 존내 중요한 대법원 전원합의체 판결 1 newfile 대단하다김짤 2025.07.24 447 0
360215 jpg 오빠 자지가 좀 작아보였어요 1 newfile 대단하다김짤 2025.07.24 572 0
360214 jpg [속보] 러시아 여객기 추락 46명 전원 사망 3 newfile 대단하다김짤 2025.07.24 367 0
360213 jpg 여친 : 어디야?? 남친 : 할머니집 여친: 사진 보내봐 3 newfile 대단하다김짤 2025.07.24 546 0
360212 jpg 비밀유지계약서 ㄷㄷㄷ newfile 대단하다김짤 2025.07.24 381 0
360211 jpg 추격자 곡성 나홍진의 신작 HOPE 3 newfile 대단하다김짤 2025.07.24 351 1
360210 jpg 남자친구 게임기를 실수로 부숴버렸다는 에타녀 4 newfile 대단하다김짤 2025.07.24 378 0
목록
Board Pagination Prev 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 ... 14410 Next
/ 14410